Определением Священного Синода Русской Православной Церкви Преосвященнейшему Меркурию определено быть епископом Ростовским и Новочеркасским.
27 июля 2011 года в ходе состоявшегося в Свято-Успенской Киево-Печерской лавре заседания Священный Синод Русской Православной Церкви постановил:
Преосвященным Ростовским и Новочеркасским быть епископу Зарайскому Меркурию, с временным сохранением должности Председателя Синодального отдела религиозного образования и катехизации (журнал №68).