Воскресная школа была создана 4 ноября 1999 года по благословению настоятеля прихода, которым в то время был игумен Меркурий (Иванов) (ныне — митрополит Ростовский и Новочеркасский, Председатель Синодального отдела религиозного образования и катехизации).
Для проведения её конфессиональной аттестации по благословению Председателя Синодального отдела религиозного образования и катехизации митрополита Ростовского и Новочеркасского Меркурия 4-5 сентября 2014 года учебное заведение посетил заведующий сектором православного образования Синодального отдела священник Алексий Алексеев.
24 апреля 2014 года в конференц-зале Калининградского собора Христа Спасителя прошла областная педагогическая конференция «Кирилло-Мефодиевские чтения».
Церемония награждения победителей конкурса «Красота Божьего мира» для кадетских, суворовских и нахимовских корпусов проходила 4 августа 2013 года в Морском соборе Кронштадта. Церемонию возглавили протоиерей Михаил Браверман и заведующий сектором образовательных конференций, чтений и конкурсов Отдела религиозного образования и катехизации Русской Православной Церкви инок Трифон (Умалатов).
22 декабря под председательством Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла состоялось епархиальное собрание Калининградской епархии. В Первосвятительском слове Его Святейшество подробно остановился на вопросах подготовки катехизаторов, социальных работников, молодежных руководителей, которые в соответствии с решениями Священноначалия должны быть назначены в помощь благочинным и настоятелям всех крупных приходов.
В рамках XX Международных образовательных Рождественских чтений состоялось совещание директоров православных школ и гимназий, на котором была представлена модель управления православным общеобразовательным учреждением в условиях введения Федерального государственного образовательного стандарта второго поколения. Как она выглядит и в чем ее преимущества, рассказывает руководитель Отдела религиозного образования и катехизации Калининградской епархии протоиерей Сергий Коротких (для журнала «Православное…
В рамках подведения итогов апробации учебного курса «Основы религиозных культур и светской этики» 24 ноября и 1 декабря 2011 года заведующий сектором ОПК Г. В. Демидов участвовал в региональных мероприятиях в Калининграде и Новосибирске, посвященных подведению итогов апробации курса «Основы религиозных культур и светской этики».
12 октября 2011 года Высокопреосвященнейший Меркурий, митрополит Ростовский и Новочеркасский, принял участие в освящении храма в честь святого благоверного князя Александра Невского в г. Балтийске (Калининградская обл.) и сослужил Святейшему Патриарху Московскому и всея Руси Кириллу, который совершил чин великого освящения и Божественную литургию в новоосвященном храме.
13 октября 2011 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл посетил православную гимназию № 1 г. Калининграда, которая расположена на территории кафедрального собора Христа Спасителя в центре города.
Вечером 10 октября 2011 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл прибыл в Калининградскую епархию. В аэропорту Храброво г. Калининграда Предстоятеля Русской Православной Церкви встречали митрополит Ростовский и Новочеркасский Меркурий, Председатель Отдела религиозного образования и катехизации Русской Православной Церкви, епископ Балтийский Серафим, духовенство Калининградской епархии.