Решением Священного Синода митрополит Меркурий включен в сотав координационной группы по преподаванию теологии в вузах
25-26 декабря 2012 года в заседания Священного Синода Русской Православной Церкви под председательством Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла принято решение образовать межведомственную координационную группу по преподаванию теологии в вузах.